楢木さんからのアドバイス
　敷金とはもちろんアパートかマンションを借りるための敷金ですよね。内定先の社内規定に拠るのかも知れませんし、住宅手当の簡易版かも知れません。また内定を確かなものにするための好意的な手段かも知れません。いずれにしてもお礼を申し上げるのは良いことです。

　お礼はメールよりも、電話が良いでしょう。「敷金を負担していただいて助かりました。ありがとうございます」と申し上げればよろしいと思います。その上で「これは特別におはからいいただいたことなのでしょうか」と確かめる手もあります。電話ですから、敷金を負担していただいたことを巡ってそれなりのコミュニケーションがとれる点が良いですね。

　内定先とは言え、もう半分以上は身内も同然ですから、気楽に連絡を取ることをお勧めいたします。